Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfia3P60469 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms