Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TspoP50637 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TspoP50637 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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TspoP50637 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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