Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Traf2P39429 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Traf2P39429 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf2P39429 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf2P39429 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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