Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms