Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Becn2P0DM65 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms