Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms