Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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