Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pot1bH7BX60 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms