Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17455G3UW87 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17455G3UW87 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17455G3UW87 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17455G3UW87 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17455G3UW87 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm17455G3UW87 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm17455G3UW87 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm17455G3UW87 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms