Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Zfp558E9Q1J0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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