Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm3173A6NAS3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3173A6NAS3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms