Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3550W4VSN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3550W4VSN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms