Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptgdr2Q9Z2J6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptgdr2Q9Z2J6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms