Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SnapinQ9Z266 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnapinQ9Z266 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnapinQ9Z266 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnapinQ9Z266 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms