Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lgr5Q9Z1P4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lgr5Q9Z1P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lgr5Q9Z1P4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms