Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms