Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Nup160Q9Z0W3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Nup160Q9Z0W3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nup160Q9Z0W3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nup160Q9Z0W3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nup160Q9Z0W3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms