Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap4s1Q9WVL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap4s1Q9WVL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4s1Q9WVL1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms