Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msl3Q9WVG9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl3Q9WVG9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl3Q9WVG9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms