Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnip1Q9WUU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnip1Q9WUU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnip1Q9WUU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms