Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUS4

Gja10, Gap junction alpha-10 protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja10Q9WUS4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja10Q9WUS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gja10Q9WUS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gja10Q9WUS4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja10Q9WUS4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gja10Q9WUS4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja10Q9WUS4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gja10Q9WUS4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms