Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn3Q9WUK7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms