Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClcnkbQ9WUB6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkbQ9WUB6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ClcnkbQ9WUB6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClcnkbQ9WUB6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClcnkbQ9WUB6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms