Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd6ipQ9WU78 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcd6ipQ9WU78 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdcd6ipQ9WU78 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms