Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AtrnQ9WU60 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AtrnQ9WU60 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AtrnQ9WU60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AtrnQ9WU60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms