Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PplQ9R269 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PplQ9R269 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PplQ9R269 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PplQ9R269 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PplQ9R269 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PplQ9R269 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PplQ9R269 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PplQ9R269 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PplQ9R269 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PplQ9R269 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PplQ9R269 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms