Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Acox1Q9R0H0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acox1Q9R0H0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acox1Q9R0H0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Acox1Q9R0H0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms