Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copg1Q9QZE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Copg1Q9QZE5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copg1Q9QZE5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms