Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ubxn8Q9QZ49 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn8Q9QZ49 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn8Q9QZ49 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms