Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo1Q9QZ11 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Exo1Q9QZ11 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms