Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh11Q9QYF1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh11Q9QYF1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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