Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp1Q9QY53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nphp1Q9QY53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nphp1Q9QY53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp1Q9QY53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp1Q9QY53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp1Q9QY53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp1Q9QY53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp1Q9QY53 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp1Q9QY53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms