Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzd4Q9QY39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd4Q9QY39 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms