Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp3Q9QY23 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp3Q9QY23 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms