Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChmQ9QXG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChmQ9QXG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChmQ9QXG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms