Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chaf1aQ9QWF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chaf1aQ9QWF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chaf1aQ9QWF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chaf1aQ9QWF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms