Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr4Q9QUK6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr4Q9QUK6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr4Q9QUK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms