Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk1eQ9JMK2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1eQ9JMK2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1eQ9JMK2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk1eQ9JMK2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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