Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp3a41aQ9JMA7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a41aQ9JMA7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms