Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prg4Q9JM99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prg4Q9JM99 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prg4Q9JM99 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prg4Q9JM99 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms