Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul3Q9JLV5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cul3Q9JLV5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms