Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkd2l2Q9JLG4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pkd2l2Q9JLG4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms