Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp4Q9JKV5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp4Q9JKV5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp4Q9JKV5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scamp4Q9JKV5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scamp4Q9JKV5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scamp4Q9JKV5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms