Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufaf3Q9JKL4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ndufaf3Q9JKL4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms