Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp39a1Q9JKJ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms