Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl3Q9JKB1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl3Q9JKB1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.6 ms