Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube2Q9JJS0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Scube2Q9JJS0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube2Q9JJS0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scube2Q9JJS0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scube2Q9JJS0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scube2Q9JJS0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scube2Q9JJS0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scube2Q9JJS0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scube2Q9JJS0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms