Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caln1Q9JJG7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Caln1Q9JJG7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caln1Q9JJG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms