Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad9Q9JIW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad9Q9JIW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smad9Q9JIW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smad9Q9JIW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad9Q9JIW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad9Q9JIW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad9Q9JIW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad9Q9JIW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms