Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2b2Q9JID9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh2b2Q9JID9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2b2Q9JID9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh2b2Q9JID9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms